《马里奥制造2》下架的原因主要有以下几点：

游戏本身没有国服和版号

《马里奥制造2》在国内没有版号和国服，而国内对于游戏发行和销售有严格的版号要求。没有版号的游戏在国内是不允许销售和发行的，因此被禁止销售也在情理之中。

玩家自制地图存在问题太多

游戏的高自由度允许玩家自定义地图，但这也导致了很多敏感问题的出现，可能涉及不良信息传播，因此被禁售。

自私、盗版等敏感问题的存在

玩家自制地图中的不良内容可能涉及自私、盗版等敏感问题，这些问题的存在也是导致游戏被禁售的原因之一。

综上所述，主要原因是游戏没有版号和国服，以及玩家自制地图中存在大量敏感问题。